A. Badan Eksekutif Mahasiswa (BEM)

Pembentukan organisasi kemahasiswaan di Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan (FKIK) Universitas Warmadewa (Unwar) diawali dengan terbentuknya suatu badan organisasi yang dikenal dengan nama Himpunan Mahasiswa Program Studi Pendidikan Dokter (HM PSPD) pada tanggal 15 Maret 2011. Pemilihan ketua HM PSPD dilaksanakan melalui Pemilu Raya (Pemira), dengan masa jabatan selama satu tahun tujuh bulan. Ketua HM PSPD adalah I Wayan Eka Los Pratama. Pengurus HM PSPD berjumlah 34 orang. Pengurus inti terdiri dari ketua, dua orang wakil ketua, dua orang sekretaris, dua orang bendahara dan empat kepala bidang. Adapun bidang-bidang yang terdapat di HM PSPD antara lain:

1. Bidang Organisasi

Bidang Organisasi terdiri dari sie PSDM dan Kastrat. Tujuan dari bidang organisasi adalah untuk mempertahankan kualitas dan kinerja mahasiswa serta mempertajam daya pemikiran kritis mengenai berbagai isu-isu yang bersifat strategis dan vital.

2. Bidang Kesejahteraan

Bidang Kesejahteraan bertujuan untuk mensejahterakan seluruh mahasiswa PSPD Unwar baik berupa fisik maupun non fisik. Bidang ini membawahi Sie Dana dan Usaha (Danus) dan Sie Pengabdian Masyarakat (Pengmas). Sie Danus  mensejahterakan mahasiswa dengan cara mencari pendanaan untuk memfasilitasi kegiatan mahasiswa. Sie Pengmas menjalankan tugasnya dalam mensejahterakan mahasiswa dengan cara mengadakan kegiatan aplikasi ilmu kedokteran yang telah didapat selama perkuliahan.

3. Bidang Minat & Bakat

Bidang Minat dan Bakat memberikan wadah untuk menampung minat dan bakat dari seluruh mahasiswa. Bidang Minat dan Bakat membawahi dua sie yaitu Sie Olahraga dan Sie Seni. Sie Olahraga terdiri dari Sie Voli, Sie Basket, Sie Sepak Bola dan Futsal serta Sie Sepeda. Sementara itu Sie Seni terdiri dari Sie Band, Sie Vocal Solo dan Paduan Suara, Sie Fotografi serta Sie Tari Tradisional.

4. Bidang Ilmiah & Penalaran

Bidang Penalaran dan Ilmiah dibentuk untuk memenuhi dan menunjang kebutuhan mahasiswa menghadapi aspek akademis dalam bidang kedokteran. Bidang ini menaungi dua seksi fungsional yaitu Sie Pendidikan dan Profesi (Pendpro) dan Sie Ilmiah.

Seiring dengan peralihan bentuk institusi dari Program Studi menjadi Fakultas Kedokteran, HM PSPD juga bertransformasi menjadi BEM FKIK Universitas Warmadewa pada tahun 2012. BEM FKIK Unwar merupakan suatu wadah pengembangan potensi – potensi akademik dan non-akademik mahasiswa, sebagai penyalur aspirasi kreatif, dan inovatif mahasiswa FKIK Unwar serta suatu Badan Organisasi yang juga turut berperan aktif di dalam mengontrol kebijakan dan sistem yang ada di institusi, sehingga dapat terciptanya suasana lingkungan kampus yang kondusif.        

BEM FKIK Unwar memiliki 7 Departemen yang memiliki tugas dan fungsi sesuai dengan tujuan terbentuknya departemen tersebut yang secara jelas tertulis pada AD/ART Lembaga Mahasiswa FKIK (LMFKIK) Universitas Warmadewa diantaranya Departemen PSDM, Danus, Kastrat, Pengmas, KHIK, Pendpro, dan Minat Bakat. Di tahun yang kedua kepengurusan BEM FKIK Universitas Warmadewa telah mampu membentuk 2 Badan Kelengkapan yaitu Tim Bantuan Medis Baswara Prada (TBM-BP) dan Kelompok Ilmiah Aesculapius (KIAs) yang secara struktur organisasi berada langsung dibawah naungan BEM FKIK Universitas Warmadewa. Prinsip BEM FKIK Universitas Warmadewa sesuai dengan lambang LMFKIK yaitu Komitmen, Loyalitas, Integritas, dan Kejujuran.

B. Dewan Perwakilan Mahasiswa (DPM)

Saat pertama berdiri, Program Studi Pendidikan Dokter Universitas Warmadewa hanya memiliki satu badan yang bergerak di bidang kemahasiswaan yaitu Himpunan Mahasiswa Program Studi Pendidikan Dokter Universitas Warmadewa (HM PSPD Unwar) yang terbentuk pada tahun 2009 masa bakti 2009-2010. Pembubaran HM PSPD Unwar 2009-2010 tidak melalui Musyawarah Mahasiswa (MUSMA). Himpunan Mahasiswa Program Studi Pendidikan Dokter Universitas Warmadewa masa bakti 2010-2011 melakukan kiat-kiat untuk memperbaiki sistem organisasi yang ada di Program Studi Pendidikan Dokter Universitas Warmadewa, bersamaan dengan hal tersebut mahasiswa menilai perlu dibentuknya suatu badan legislatif yang akan berjalan bersama dengan HM PSPD Unwar. Tahun 2011, terbentuklah Dewan Perwakilan Mahasiswa Program Studi Pendidikan Dokter Universitas Warmadewa (DPM PSPD Unwar). Dewan Perwakilan Mahasiswa Program Studi Pendidikan Dokter Universitas Warmadewa pada saat itu diketuai oleh Anak Agung Ngurah Bagus Satya Sueningrat yang masih menjabat sebagai wakil ketua HM PSPD Unwar. Hal tersebut menimbulkan kejanggalan dalam kesinergisan antara kedua organisasi mahasiswa yang dimiliki PSPD Unwar.

Musyawarah Mahasiswa pertama (MUSMA I) diadakan pada tahun 2012 yang bersamaan dengan berubahnya status PSPD Unwar menjadi Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Warmadewa (FKIK Unwar). Perubahan status tersebut mempengaruhi Anggaran Dasar dan Anggaran Rumah Tangga (AD/ART) organisasi kemahasiswaan yang dimiliki FKIK Unwar. Terjadi perubahan besar pada AD/ART pada MUSMA pertama organisasi kemahasiswaan FKIK Unwar. Perubahan tersebut meliputi terbentuknya Lembaga Mahasiswa Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Warmadewa (LMFKIK Unwar). Lembaga Mahasiswa FKIK Unwar terdiri dari dua badan sebagai motor penggeraknya. Himpunan Mahasiswa PSPD berubah nama menjadi Badan Eksekutif Mahasiswa Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Warmadewa (BEM FKIK Unwar) yang bergerak sebagai eksekutor dari LMFKIK Unwar dan DPM PSPD Unwar berubah nama menjadi Dewan Perwakilan Mahasiswa Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Warmadewa (DPM FKIK Unwar) sebagai badan legislatif dari LMFKIK Unwar.

C. Kelompok Ilmiah Aesculapius (KIAs)

Kelompok Ilmiah Aesculapius (KIAs) bermula dari sekolompok mahasiswa FKIK Unwar yang memiliki ketertarikan yang sama pada bidang penelitian dan tulis menulis ilmiah ditahun 2009. Namun sampai dengan tahun 2010 kelompok mahasiswa ini masih belum diresmikan sebagai suatu kelompok ilmiah mahasiswa FKIK Unwar. Pada Tahun 2011 kelompok ilmiah ini diresmikan pada tanggal 1 Agustus yang dikenal dengan nama Kelompok Ilmiah Aesculapius (KIAs). Nama Aesculapis diambil karena figur beliau sebgai dewa penyembuh, dimana KIAs memiliki visi yaitu untuk menghasilkan karya tulis ilmiah yang dapat menyembuhkan permasalahan kesehatan di Indonesia dan dunia. KIAs merupakan badan kelengkapan dibawah naungan Badan Eksekutif Mahasiswa Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Warmadewa. KIAs berfungsi sebagai wadah pembinaan dan pengembangan ilmu pengetahuan, penyalur aspirasi minat, bakat serta pemberdayaan kreativitas mahasiswa FKIK Unwar khusunya dalam bidang ilmiah. KIAs FKIK Unwar merupakan organisasi yang berorientasi pada keilmiahan, pengetahuan, Evidence Based dan memberikan manfaat pada masyarakat, telah banyak prestasi yang dimiliki pada bidang penelitian terutama pada kegiatan PKM.

D. Tim Bantuan Medis Baswara Prada (TBM BP)

Pada tahun 2009, terbentuk Tim Bantuan Medis yang dipelopori oleh beberapa mahasiswa yang memiliki kesamaan visi misi terhadap pengetahuan medis sebagai disiplin ilmu yang harus diamalkan sebagai wujud peduli pada kemanusiaan khususnya pada keadaan kegawatdaruratan medis. Saat itu Tim Bantuan Medis (TBM) Baswara Prada bernama TBM Dirga Bhuana. TBM Dirga Bhuana mengalami banyak hambatan dalam kepengurusan sehingga sempat vakum. Pada akhir  tahun 2013, atas inisiatif beberapa mahasiswa TBM Dirga Bhuana diaktifkan kembali dan membentuk diri sebagai angkatan perintis. Angkatan perintis melakukan pelatihan bagi calon angkatan 1 dan menetapkan atribut yang digunakan. Setelah mengikuti musyawarah anggota sebanyak 2 kali dan mengadakan beberapa kali rapat anggota, pada tanggal 4 Maret 2014 disepakati penggantian nama TBM Dirga Bhuana menjadi TBM Baswara Prada. Baswara berarti penolong atau pemberi bantuan dan Prada yang berarti sinar suci, sehingga dapat diartiakan secara harfiah sebagai sang penolong dengan sinar suci. Tanggal 4 Maret 2014 juga ditetapkan sebagai tanggal terbentuknya TBM Baswara Prada.